Timothy Keller fue criado en Lehigh Valley, Pennsylvania. Es graduado de Bucknell University (BA, 1972), Gordon-Conwell Theological Seminary (M.Div., 1975) y el Westminster Theological Seminary, donde recibió su Doctorado del Ministerio en 1981, bajo la supervisión de Harvie M. Conn. Se convirtió en cristiano mientras estaba en Bucknell University, debido al ministerio de InterVarsity Christian Fellowship, del cual luego sirvió como parte del equipo ministerial.
Él fue ordenado por Presbyterian Church in America (PCA) y sirvió como pastor en Virginia por nueve años, mientras servía como director de church planting for the PCA. También fue miembro de la facultad de Westminster Theological Seminary, en Philadelphia, Pennsylvania, donde él y su esposa Kathy estaban involucrados en el ministerio urbano.